Category Archives: Books

Social Media Mining and Bioinformatics (with R)

In June and July, I receive copies of two books,

For the first one, two recent interesting books deal with the same topic. Reza Zafarani, Mohammad Ali Abbasi and Huan Liu published last year Social Media Mining: An Introduction. Actually, the book can be downloaded from dmml.asu.edu. And – of course – there is Matthew A. Russell‘s Mining the Social Web. The main interest of this new book seems to be that it should be just perfect for R users !

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Merchants of doubt, et le fonctionnement de la science

Il y a quelques jours, La Presse  mettait en ligne un texte intéressant, La BBC déclare la guerre à la « fausse science »

Les changements climatiques n’existent pas, les campagnes de vaccination sont dangereuses et votre téléphone cellulaire est en train de vous tuer à petit feu.

Il fut un temps où il était possible d’entendre ce genre d’opinions à la BBC. Des opinions scientifiques marginales, mais soutenues avec vigueur par certains chercheurs, et que le diffuseur britannique rapportait par souci « d’impartialité ». Mais cette ère est révolue.

Dans un document publié en juillet, la BBC prend une position très ferme sur la fausse science, qu’elle veut désormais évacuer de ses reportages.

« L’impartialité dans la couverture scientifique ne consiste pas simplement à faire état d’un large spectre de points de vue », écrit la BBC, qui croit qu’une application « trop rigide » des principes d’impartialité peut conduire à un « faux équilibre » dans les reportages.

La réflexion de la BBC a été suscitée par sa propre couverture des changements climatiques, qui a longtemps donné la parole aux climatosceptiques. Or, ceux-ci risquent maintenant d’avoir plus de difficulté à s’y voir offrir un micro.

Cet article m’a fait penser à un livre passionnant que j’avais lu l’automne dernier, Merchants of Doubt. Dans mon dernier compte rendu de lecture (ça faisait longtemps) je parlais de Big Data, a revolution that will transform how we live, work and think signé Viktor Meyer-Schönberger et Kenneth Cukier, et de The signal and the noise: Why Most Predictions Fail – but Some Don’t écrit par Nate Silver. Dans ce livre, on voyait comment on était passé d’une recherche de lien causal à une simple recherche de corrélation, dans des gros volumes de données. En fait, je ferais un parallèle avec le livre Merchants of Doubt, car comme l’expliquent Naomi Oreskes et Erik Conway, c’est précisément ce que combattent ce qu’ils appellent les marchants de doutes : tant qu’une relation causale n’est pas établie, le scientifique se devrait de douter (quelques pages – le premier chapitre – sont d’ailleurs en ligne). C’est cette idée que réfute  La BBC déclare la guerre à la « fausse science », et c’est l’histoire de ce principe (et des dérives qui ont suivi) que raconte ce livre.

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La fresque de Joe Sacco

En matière de bandes dessinées relative à la grande guerre, j’ai longtemps cru que Jacques Tardi serait impossible à égaler. Lire C’était la guerre des tranchées ou Putain de Guerre était une expérience marquante. Mais il y a quelques semaines, j’avais acheté la fresque de Joe Sacco à mon fils, car je trouve qu’ils dessinent un peu de la même manière, avec des dessins denses et touffus, remplis de détails,

Comme toujours, Joe Sacco a un dessin qui marque. Mais alors que je lui reprochais toujours de parler trop dans ses livres, cette fois, on a une fresque de 7 mètres de long, silencieuse, devant laquelle on peut se planter, et regarder, comme la tapisserie de Bayeux

Et depuis une semaine, la fresque a été reproduite sur 130 mètres de long, dans le long couloir de la station de métro Montparnasse, dans le cadre des commémorations pour le centenaire

Je trouve l’idée incroyable, et j’avoue avoir hâte de vivre l’expérience. Vivement mardi prochain, où j’ai justement une correspondance à Montparnasse, en revenant de mon excursion à Londres !

1 tous les dessins sont extraits de La Grande Guerre, par Joe Sacco, publié en Français chez Futuropolis, et la photo devant la fresque est signée Bertrand Guay / AFP

Approches Statistiques du Risque

Il semble que l’ouvrage approches statistiques du risque, édité par Jean Jacques Droesbeke, Myriam Maumy-Bertrand, Gilbert Saporta et Christine Thomas-Agnan soit finalement paru, selon Gilbert Saporta. Ou devraient paraître – au pire – dans les jours à venir (je le vois pas encore sur le site de Technip). Les 400 pages reprennent les mini-cours que nous avions fait aux Journées d’Etudes Statistique de 2010, au CIRM, avec Patrice Bertail, Anne-Laure Fougères, Stéphane Loisel, Philippe NaveauEric Parent et Jean-Marc Tallon. Pour ma part, mes slides et mes notes de cours traînent quelque part sur le blog. Je garde un très bon souvenir de cette semaine de mini-cours, qui présentaient l’avantage d’être très complets, avec une introduction aux mesures de risques et aux lien avec la théorie de la décision, à la théorie du risque, aux notions simples d’extrêmes, de lois multivariés, et d’extrêmes multivariés, avec des applications en hydrologie, en santé, et en assurance. Avec bien entendu l’introduction historique de Jean Jacques. Même si les documents ont été écrits voilà déjà presque cinq ans, j’ai survolé mes chapitres il y a quelques semaines, et j’ai l’impression qu’ils restent d’actualité pour tous ceux qui s’intéressent au sujet (et ils sont nombreux me semble-t-il).

Piketty et Rubinstein sur l’économie

Pendant ma semaine de relâche, @reza_izaa me demandait – sur Twitter – si je pensais commenter un passage dans l’introduction du dernier livre de Thomas Piketty, Le capital au XXIème siècle. Bien que ce livre ait fait beaucoup parlé (en particulier dans la communauté des blogueurs économistes anglophones – le livre sortant officiellement demain en anglais) je dois avouer ne pas l’avoir lu, faute de temps (et parce que le livre – en version originale – est cher en Amérique du nord). J’avais vu en revanche des graphiques très intéressants sur le site associé au livre (sur http://piketty.pse.ens.fr/fr/capital21c). Vue la présence médiatique de Thomas Piketty (même en vivant de l’autre côté de l’Atlantique, on ne peut pas la manquer), je ne vais pas faire l’affront de faire un portrait de l’auteur. Je rappellerais juste qu’avant de rejoindre l’EHESS, Thomas a étudié les mathématiques, qu’il a toujours été reconnu comme économiste – avec un prix de l’AFSE à la fin de son doctorat  – et qu’il a traavillé aux États-Unis dans le cadre d’un stage post-doctoral, au MIT (ce qui lui donne une légitimité dans son propos). Il a aussi un engagement fort en politique (au sens large du terme, j’entends par là qu’il ne se contente pas de faire de l’économie descriptive, mais semble aussi intéressé par les applications de ses travaux). Le paragraphe que @reza_izaa m’avait envoyé était le suivant (je le mets ici dans son intégralité pour ne pas déformer le propos)

Je ne pense pas avoir de légitimité pour critiquer ce point de vue. Même si j’observe également qu’il existe des différences importantes entre les économistes français et les économistes américains (mais là encore, les auteurs du blog frogonomics par exemple auraient plus de légitimité que moi pour analyser cette différence). Je partage son admiration pour bon nombre de chercheurs passés par l’EHESS. Mais je ne crois pas partager sa vision de l’économie mathématique (je préfère le terme formalisée) considérée comme étant “infantile“. Cela dit, je retrouve ici que Thomas Piketty a un réel talent pour l’écriture. Par exemple, je pense qu’on pourrait passer des heures à faire l’exégèse de la phrase commençant par “disons le tout net”. Ainsi, le choix du mot “idéologique” me semble (volontairement) tendancieuse: tout système logique et formel est – par définition – idéologique. Mais le mot a une tout autre connotation, que celle d’un système logique (que j’ai retrouvé en revanche dans un autre livre dont je reparlerais dans quelques instants). Cela dit, il confirme les interrogations que j’ai depuis des années, lorsqu’on me demande si je suis un mathématicien ou un économiste. Lorsque j’étais dans un département d’économie en France, je me sentais davantage mathématicien, mais maintenant que j’ai rejoint un département de mathématiques, je me sens à nouveau économiste. Je préfère les publications de mathématiques à celles d’économie, mais j’ai souvent préféré les conférences et les séminaires d’économie. D’ordinaire, les auteurs des livres essayent d’associer le lecteur (d’où l’importance du nous dans les ouvrages scientifiques), mais là, Thomas a réussi à mettre une distance – avec moi en tous cas – dont il est dur de faire abstraction quand on avance dans la lecture (j’admets ne pas avoir lu le livre, mais j’ai survolé le début dans un format électronique… ce que je n’appelle pas lire un livre). Cela étant dit, j’espère trouver le temps (il en faudra manifestement) pour lire le livre en entier, lors d’un prochain passage en France.

En fait, il se trouve que j’avais mis dans mes valises (pour mes quelques jours de repos) un joli petit livre d’Ariel Rubinstein, Economic Fables (publié par openbookpublishers), en version papier cette fois. Ariel Rubinstein (אריאל רובינשטיין) est un autre économiste, professeur à Tel Aviv et à NYU. Il a publié aussi des livres de référence, dont une très bonne introduction à la théorie des jeux. Quand on ne baigne pas dans la culture juive, on rate certaines subtilités (car le livre raconte des expériences personnelles d’Ariel, en lien avec ses travaux de recherche, sur les décisions, la rationalité, les négociations, etc, et la religion – juive – joue une part importante). Dans son introduction, il revient sur le choix de son titre, que je mettrais en relation par rapport au petit pic lancé par Thomas Piketty (ceux qui savent lire sur un écran pourront lire le livre intégralement sur http://www.openbookpublishers.com/reader/136)

Viennent alors trois fables très jolies, permettant d’expliquer plusieurs problèmes classiques de théorie de la décision. Mais je retiendrais surtout la discussion qui suit les trois fables.

Ce (petit) livre est fabuleux, et présente des dizaines de petites anecdotes fabuleuses, que je reprendrais probablement le jour où je redonnerais un cours de théorie de la décision !